D【解析】常规问题和非常规问题是矛盾关系，且都是问题的一种。A项，期中考试与期末考试是反对关系，不符合题干的逻辑关系，排除;B项，顶层设计与基层落实是反对关系，不符合题干的逻辑关系，排除;C项，豪华装修与简单装修是反对关系，不符合题干的逻辑关系，排除;D项，转基因油与非转基因油是矛盾关系，且都是油的一种，符合题干的逻辑关系，当选。因此，选择D。