【答案】D。第一步，本题考查不定方程问题。第二步，西瓜的单价为质数且为偶数，质数中唯一的偶数为2，所以西瓜为2元/千克，设苹果和西瓜各购买x和y千克，可得方程6x+2y=60，化简为3x+y=30，根据数字特性，30和3x均为3的倍数，所以2y也必然为3

　　的倍数即y为3 的倍数，为了让小红购买的水果数量最少，则便宜的水果少买，所以西瓜的数量最少为3千克，剩下的钱还可以买9千克苹果，总共买了3+9=12千克水果。故本题正确答案选D。