基因和性状、疾病之间有着非常复杂的关系，破译这一关系最原始的方法是上世纪中叶建立的基因连锁分析：通过比较受遗传疾病影响的家族中不同成员的染色体条带或遗传标记的异同，在染色体上定位致病基因。这种方法在研究单基因遗传病方面取得了很多成绩，但其缺点是分辨率有限，很难准确地定位到单个基因上。
这段文字意在说明：
A. 基因和疾病的关系难以准确破译
B. 基因连锁分析方法存在明显缺陷
C. 单基因遗传病更容易找出病因
D. 基因分析有助于精准治疗遗传病
第一步，分析文段。文段先提出基因连锁分析这一话题，并对其进行解释说明，最后通过一个转折关系指出这种方法的缺点是什么。文段为“分—总”结构，尾句是主旨句，转折之后是重点，强调基因连锁分析方法存在问题。
第二步，对比选项。B项是文段主旨的同义替换。
因此，选择B选项。
A项、C项和D项：均没有提到文段的核心话题“基因连锁分析方法”。
