【答案】D。本题考核定金、违约金。选项A、C错误。《担保法》第九十一条规定，定金的数额由当事人约定，但不得超过主合同标的额的20%。本题中，合同总价款是100万，100×20%=20万，即乙公司支付的30万定金中只有20万部分是有效的，因甲公司违约适用定金罚则时，只能要求甲公司双倍返还40万，不能要求甲公司双倍返还60万。选项B错误，选项D正确。《合同法》第一百一十六条规定，当事人既约定违约金，又约定定金的，一方违约时，对方可以选择适用违约金或者定金条款。据此可知，定金罚则与违约金不能同时适用，只能选择其一适用。所以答案选D。